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中析检测

植物染色质高级结构检测

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咨询量:  
更新时间:2025-05-30  /
咨询工程师

信息概要

植物染色质高级结构检测是通过分析染色质的三维构象、空间排布及其动态变化,揭示基因表达调控机制的重要技术手段。该检测服务面向科研机构、农业育种企业及生物技术公司,提供染色质相互作用、拓扑关联域(TADs)分析、核小体定位等高精度数据,助力植物表观遗传学研究、作物遗传改良及抗逆性开发。检测结果可为功能基因组学、分子育种及合成生物学领域提供关键数据支撑。

检测项目

  • 染色质三维构象分析
  • 染色质互作频率检测
  • 拓扑关联域(TADs)边界定位
  • 核小体占位与间距测定
  • 染色质可及性评估
  • Hi-C技术全基因组互作图谱构建
  • 染色质环(Chromatin Loops)识别
  • 组蛋白修饰空间分布分析
  • 染色体区室(A/B Compartment)划分
  • 染色质动态压缩状态监测
  • 转座酶可及染色质测序(ATAC-seq)整合分析
  • DNA甲基化与染色质结构关联研究
  • 增强子-启动子互作验证
  • 异染色质与常染色质边界鉴定
  • 染色质重塑因子作用位点检测
  • 单细胞染色质构象分析
  • 荧光原位杂交(FISH)空间验证
  • 染色质断裂与修复位点定位
  • 基因组三维模型重构
  • 环境胁迫下染色质结构动态变化追踪

检测范围

  • 粮食作物(水稻、小麦、玉米)
  • 经济作物(棉花、大豆、油菜)
  • 园艺植物(番茄、拟南芥、菊花)
  • 林木类(杨树、松树、桉树)
  • 药用植物(人参、甘草、青蒿)
  • 藻类与苔藓植物
  • 转基因植物品系
  • 突变体与遗传修饰材料
  • 野生型与栽培种对比样本
  • 多倍体植物(如马铃薯)
  • 濒危保护植物
  • 极端环境适应型植物
  • 作物杂交后代群体
  • 植物病原互作样本
  • 植物组织特异性样本(根/叶/花)
  • 不同发育阶段样本
  • 表观遗传修饰植株
  • 人工合成染色体材料
  • 植物细胞系与原生质体
  • 植物病毒侵染样本

检测方法

  • Hi-C技术(全基因组染色质互作捕获)
  • ChIP-seq(染色质免疫共沉淀测序)
  • ATAC-seq(转座酶可及染色质测序)
  • DNase-seq(核酸酶超敏感位点测序)
  • MNase-seq(微球菌核酸酶消化测序)
  • 3C/4C/5C技术(染色体构象捕获系列)
  • Single-cell Hi-C(单细胞染色质构象分析)
  • ChromEMT(染色质电子显微镜断层扫描)
  • FISH(荧光原位杂交空间验证)
  • ChIA-PET(染色质互作分析配对末端标签测序)
  • DamID(DNA腺嘌呤甲基转移酶识别技术)
  • CUT&Tag(靶向染色质蛋白定位分析)
  • Micro-C(高分辨率染色质构象分析)
  • SPRITE(多重染色质互作捕获技术)
  • GAM(基因组结构显微切割技术)

检测仪器

  • 高通量测序仪(Illumina NovaSeq)
  • 第三代测序仪(PacBio Sequel II)
  • 冷冻透射电子显微镜
  • 染色体显微切割系统
  • 激光共聚焦显微镜
  • 超高速离心机
  • 荧光定量PCR仪
  • 超声破碎仪
  • 生物分析仪(Agilent 4200)
  • 流式细胞分选仪
  • 自动化液体处理项目合作单位
  • 质谱仪(Q-Exactive HF-X)
  • 微量紫外分光光度计
  • 低温恒温培养箱
  • 三维基因组数据计算服务器

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